《黑神话：悟空》的故事直到最后都可能令人困惑。这是对中国小说《西游记》的重新构想，讲述了一群不拘一格的角色护送僧侣唐三藏前往佛教圣地，以取回一系列神圣的经文。《黑神话：悟空》的故事发生在猴子主角孙悟空完成了他的旅程并成为了佛之后很久。他拒绝了新获得的地位，返回了他的出生地山峰。孙悟空与神祇二郎神对决，二郎神试图将他带回天庭，结果孙悟空再次被封在石中作为惩罚。
在《黑神话：悟空》中，玩家控制的是他的猴子属下之一，被称为“天命人”，负责寻找分散在世界各地的悟空失落的遗物。在找到六件遗物中的五件，并追踪到悟空的武器和盔甲之后，天命人回到华果山，发现第六件也是最后一件遗物，并迎接自己的命运。《黑神话：悟空》有两个结局，这两个结局完全取决于玩家是否完成了一个可选的boss战，每个结局对游戏的神话历史背景都有重要影响。
孙悟空是《黑神话：悟空》的最终boss
石猴/圣人悟空与天命人的对决
当天命人返回华果山时，老猴子解释了他旅程中的两个重要点：其一，五件遗物分别代表了孙悟空的五种感官，第六件则代表了他的心智；其二，天命人将成为悟空转世的容器。在地平线上，他们看到一个弯腰冥想的猴子身躯，显得老迈而坚硬。
老猴子解释说，这就是孙悟空的壳，天命人需要打败他的身体并继承他的灵魂，才能成为他的继任者，之后旅程将重新开始。这表明，在《黑神话：悟空》的世界中，并没有一个单一的猴王，孙悟空被他的继任者反复杀死和转世。整个《西游记》和《黑神话：悟空》似乎在以一种时间循环的形式重复自己。天命人将成为新的孙悟空，统治华果山的猴子，并最终死去，以便另一个天命人能够接管。
朱八戒对这种循环表示反对，试图让天命人放弃他的命运。然而，老猴子用魔法墙封锁了战场，天命人被迫面对自己的命运。尽管不是《黑神话：悟空》中最难的boss，石猴，正如他的生命值条所示，还是相当具有挑战性的。然而，天命人最终打破了他的壳，石猴在一阵光芒中变成了圣人悟空——基本上是天命人自己的克隆体。
圣人悟空使用他的杖从天命人那里重新吸收了自己的感官（遗物），但仍然在与天命人的战斗中失败。他跪倒在地，化作一阵树叶，这标志着旧的孙悟空已经真正死去。天命人重新获得了他的遗物，继承了新的猴王的身份。
《黑暗神话：悟空》的坏结局
天命人继承孙悟空的皇冠
天命人在《黑暗神话：悟空》的截图中跪下。
在《黑暗神话：悟空》的正常结局中，天命人成为了悟空，正如他一直注定要做的那样。老猴子独白道关于孙悟空传说的不可靠性：他真的获得了佛陀身份吗？这段旅程真的发生过吗？无论如何，一个新的传奇即将开始，老猴子从水中取出孙悟空的金色头箍，戴在天命人的头上。一个简短的场景展示了孙悟空坐在琥珀池中，大概是在他出生的石蛋里。接着，字幕突然开始滚动，这意味着天命人可能还有更多的猴王灵魂尚未吸收。
然而，这是否真的算是一个“好”结局无疑值得讨论。在《西游记》中，孙悟空代表着不受限制的欲望，而他的头箍代表着节制。如果不完美地将它们类比于西方的心理学概念，孙悟空是本我，而头箍是超我。这是对猴王在经历了一场凶猛的暴行之后强加的。对天命人来说，它象征着成就、力量、佛陀身份——但也意味着自由意志的丧失。之前的孙悟空拒绝了这个命运是有原因的，而新的孙悟空的现实可能也并不太愉快。
玩家们在游戏结束时会被留给这些问题，虽然他们可以在通关后继续玩《黑暗神话：悟空》，清理一些附加内容，也许会找到更多的答案。
《黑暗神话：悟空》的真实结局
击败二郎神与四大天王
变身后的二郎神在《黑暗神话：悟空》的截图中呈现为一只巨大的狮子。
虽然在击败悟空后会出现字幕，但还有一个真正的最终 boss 和秘密结局片段，玩家只能通过继续使用原来的存档来解锁——换句话说，就是不启动新游戏+。为了达到这一点，他们必须再次追踪二郎神，神圣的神祇，并在一个更困难的遭遇中击败他。之后，他们将被传送到一个秘密的雪地区域，天命人将变成一只巨大的石猴，与四大天王同时对战。
二郎神随后将变身为一只巨大的狮子兽，天命人需要在一对一的决斗中击败他。完成这个秘密 boss 战后，会解锁一个新的结局动画片段，开头是天命人在击败孙悟空后跪在老猴子面前。他的眼睛睁得很大，接着一个动画场景开始回顾《西游记》的亮点，顺序倒退。这标志着天命人获得了孙悟空的记忆，成为了真正意义上的猴王。
尽管有关于天命人旅程的更多额外、秘密甚至更真实结局的传言，但迄今为止发现的只有这两个结局。其中一个显然是更令人满意的结局，需要更多的努力，因此暂时看来，可以宣称后者为“真实”结局。不过，额外的游戏过程可能会揭示《黑暗神话：悟空》中更多的秘密，包括额外的结局。